« Grand livre » [28x41cm] [comporte une table des matières ; les chapitres "ateliers et musée » et « frais de bureaux » sont présents dans la table des matières, mais n'ont pas été réalisés ; comprend les dépenses relatives au matériel d'entretien (1874-1927), aux transports (1874-1906), aux déplacements (1874-1918), au chauffage (1874-1953), à l'éclairage (1874-1926), aux installations du musée et ateliers (1878-1928), ainsi qu'une liste d'achats d'objets et de moulages (1904-1906 et 1920)].
« Menues dépenses extraordinaires pour le musée » [20x30cm] (14/05/1897 - 09/01/1947).
Registre des bons de commande [20x31cm] (07/01/1901 – 23/03/1940) [comprend également le registre des « remises des mandats » (19/02/1905 – 02/11/1929) et des « fournitures de charbon »] (1940-1946).
« Journal des entrées » [20x30cm] [registre des ventes de tickets] (01/06/1953 – 05/01/1958).

Registre 1 [28,5x37cm] (29 juillet 1922 au 30 septembre 1926).
Registre 2 [28,5x37cm] (1er octobre 1926 au 31 juillet 1929).
Registre 3 [28,5x37cm] (31 juillet 1929 au 1er février 1932).
Registre 4 [28,5x37cm] (1er juin 1937 au 31 mars 1939).

Registre 1 [20,5x30,5cm] (6 novembre 1868 au 30 décembre 1876).
Registre 2 [23,5x35cm] (3 janvier 1877 au 23 décembre 1887).

Registre 4 [24,5x36cm] (1er juin 1898 au 8 juin 1908).
Registre 5 [24,5x36cm] (10 juin 1908 au 11 septembre 1920).

« Ébauche du livre des donateurs » [il s’agit d’un registre de donateurs par ordre alphabétique] [26x32cm] [1862-?].
Registre des échanges [27,5x34cm] (02/10/1867-15/01/1914) [il relève les échanges des objets et ouvrages du musée avec d’autres organismes et personnes privées ; contient également une liste d'objets mis en dépôt au Louvre (1908)].
« Bordereaux de versement, État des Tickets, vignettes et formules » [26x32cm] [il s’agit d’une couverture de registre, dont les feuilles ont été perdues, qui comprend deux listes reportées sur les plats internes des couvertures, l’une concernant les collectionneurs du musée et l’autre les objets de la salle II.]

Registre n° 1 [29x42,5cm] [comporte une liste d'ouvrages en cours de publication] (1865-1882).
Registre n° 2 [29x42,5cm] (1892-1930).
Registre n° 3 [30x44cm] (1930-1971).
Registre n° 4 [28,5x45] (1971-1992).
Registre n° 5 [28,5x45cm] (1992-2004).
Registre n° 6 [28,5x43cm] (2005-2016).
Registre n° 7 [28.5x43cm] (2016-…).

Registre 7 [30x44,5cm] (2 janvier 1952 au 30 septembre 1954).
Registre 8 [30x44,5cm] (1er octobre 1954 au 31 août 1957).

Registre des donateurs par ordre alphabétique [27x34cm] [mis à jour en 1994, 1999 et 2004].
Registre annuaire des relations scientifiques [27x34cm] [comprend également un fascicule intitulé « Liste dressée en vue de la nomination de correspondants de la commission des monuments historiques (section des monuments pré-historiques) » [après 1867]] [sans date].

Cahier d'inventaire des magasins de la bibliothèque situés à l'entresol [17,5x22,5cm] (avant 1948) [plusieurs pages ont été retirées].
Inventaire d'ouvrages par format et auteur [17x22cm].
« Registre des visiteurs de la bibliothèque et salle d'études » [20,5x31,5cm] (1935-2015).
«Livre de sorties » [12x19cm] [registre des livres sorties pour prêt et pour reliure, ainsi que de leurs remises ; comprend également plusieurs listes - « de livres à acheter », de « cartes à coller sur toile », de dons d'ouvrages et d'abonnements à des revues scientifiques ; contient des fiches manuscrites ; le registre d'ouvrages sorties pour reliure est organisé en fonction du plan de classement de la bibliothèque] (14/07/1871 – 19/01/1944).

« Catalogue alphabétique par nom d'auteurs » [27x33cm].
Catalogue d'auteurs [20x30,5cm] [comprend également 3 planches affichant le plan de classement par pays étranger, par département et par thématiques diverses].