« Grand livre » [28x41cm] [comporte une table des matières ; les chapitres "ateliers et musée » et « frais de bureaux » sont présents dans la table des matières, mais n'ont pas été réalisés ; comprend les dépenses relatives au matériel d'entretien (1874-1927), aux transports (1874-1906), aux déplacements (1874-1918), au chauffage (1874-1953), à l'éclairage (1874-1926), aux installations du musée et ateliers (1878-1928), ainsi qu'une liste d'achats d'objets et de moulages (1904-1906 et 1920)].
« Menues dépenses extraordinaires pour le musée » [20x30cm] (14/05/1897 - 09/01/1947).
Registre des bons de commande [20x31cm] (07/01/1901 – 23/03/1940) [comprend également le registre des « remises des mandats » (19/02/1905 – 02/11/1929) et des « fournitures de charbon »] (1940-1946).
« Journal des entrées » [20x30cm] [registre des ventes de tickets] (01/06/1953 – 05/01/1958).

Registre 1 [28,5x37cm] (29 juillet 1922 au 30 septembre 1926).
Registre 2 [28,5x37cm] (1er octobre 1926 au 31 juillet 1929).
Registre 3 [28,5x37cm] (31 juillet 1929 au 1er février 1932).
Registre 4 [28,5x37cm] (1er juin 1937 au 31 mars 1939).

Registre 1 [20,5x30,5cm] (6 novembre 1868 au 30 décembre 1876).
Registre 2 [23,5x35cm] (3 janvier 1877 au 23 décembre 1887).

Registre 4 [24,5x36cm] (1er juin 1898 au 8 juin 1908).
Registre 5 [24,5x36cm] (10 juin 1908 au 11 septembre 1920).

« Ébauche du livre des donateurs » [il s’agit d’un registre de donateurs par ordre alphabétique] [26x32cm] [1862-?].
Registre des échanges [27,5x34cm] (02/10/1867-15/01/1914) [il relève les échanges des objets et ouvrages du musée avec d’autres organismes et personnes privées ; contient également une liste d'objets mis en dépôt au Louvre (1908)].
« Bordereaux de versement, État des Tickets, vignettes et formules » [26x32cm] [il s’agit d’une couverture de registre, dont les feuilles ont été perdues, qui comprend deux listes reportées sur les plats internes des couvertures, l’une concernant les collectionneurs du musée et l’autre les objets de la salle II.]

Registre n° 1 [29x42,5cm] [comporte une liste d'ouvrages en cours de publication] (1865-1882).
Registre n° 2 [29x42,5cm] (1892-1930).
Registre n° 3 [30x44cm] (1930-1971).
Registre n° 4 [28,5x45] (1971-1992).
Registre n° 5 [28,5x45cm] (1992-2004).
Registre n° 6 [28,5x43cm] (2005-2016).
Registre n° 7 [28.5x43cm] (2016-…).

Muséum national d’Histoire naturelle, Paris [MAN 29139.A, 29144.A à 29144.D, 29145.A à 29145.C, 29157, 29187.A, 29187.B, 29188.A à 29188.C, 29189.A à 29189.E, 29191, 29192.A à 29192.C, 29196.A à 29196.I, 29197.A à 29197.C, 48143.01 à 48143.04, 48475.01 à 48475.04, 48476.01, 48476.02, 48581.01, 48581.02, 48582.01, 48582.02, 48583.01, 48584.01, 48584.02, « sans numéro 18524 » à « sans numéro 18526 », « sans numéro 24790.01 » à « sans numéro 24790.08 », « sans numéro 25277.01 » à « sans numéro 25277.14 », « sans numéro 26040.01 » à « sans numéro 26040.06 », « sans numéro 83 » à « sans numéro 85 » ; dépôt consenti sans arrêté entre 1865 et 1913 ; 87 objets de la faune Piette ]. - Engagement de la procédure de dépôt et suivi administratif : proposition de fin de dépôt n°200900446 (30 /03/ 2009), ampliation de l'arrêté ministériel de fin de dépôt n°200900446 (15/05/2009), attestations de décharge (2009), correspondance (2004-2009), récolement (03/06/2004).

Bataillard Paul [MAN 19100 ; hache acheuléenne ; échange n°93 envoyé le 3 septembre 1872] : inventaire (1872).
Charvet Jean-Baptiste [MAN 17756, 17757 ; poids ovale en pierre marqué d’un V, fragment d’un grand bol ; échange n°73 envoyé en 1872] : inventaire (1872).
Daliphard [MAN 17765 ; bol surbaissé en terre brune provenant de la Seine-Inférieure ; échange n°63 envoyé le 10 décembre 1871] : inventaire (1871).
De Morgan Henri [MAN 24037 à 24066 ; 29 objets ; échange envoyé le 7 janvier 1878] : inventaire (1878).
Duruy Victor Jean [MAN 4233 à 4450 ; collection de Bruniquel ; don envoyé en 1865] : courrier, inventaire (1865-2009).
Fornier de Dinan [MAN 9225 ; 15 petites hachettes votives en bronze provenant de Bretagne ; échange n°13 envoyé le 20 décembre 1868] : inventaire (1868).
Lenoir [MAN 20841 à 20843 ; petit éclat de silex taillé provenant de Tarne-et-Garonne, incisives de cervidé ; échange n°108 envoyé le 5 octobre 1873] : inventaire (1873).
Maîre Abel [MAN 17605 à 17607, 17612 à 17627 ; 19 objets ; échange n°235 envoyé le 23 janvier 1872 ; échanges n°221 et 235 envoyés le 27 janvier 1872] : inventaires (1872).
Micault [MAN 23827 ; hache polie provenant d’Hillion ; échange n°181 envoyé le 27 avril 1877] : inventaire (1877).
Reverdit [MAN 22018 à 22077 ; 59 objets ; échange n°130 envoyé le 1er octobre 1874]: inventaire (1874).
Robinot-de-Saint-Cyr Armand [MAN 20948 à 20957 ; 9 objets ; échange n°110 envoyé le 15 novembre 1873] : inventaire (1873).